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Unterschied zwischen „Transkriptionsaktivität“ und „RNA-Expression“

Unterschied zwischen „Transkriptionsaktivität“ und „RNA-Expression“


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Ich arbeite mit einem Netzwerkobjekt, bei dem die Knoten verschiedene Ereignisse in der Molekularbiologie sind.

Speziell; Katalytische Aktivität von X, RNA-Expression von X, GTP-gebundene Aktivität von X, Kinase-Aktivität von X, Oxidoreduktase-Aktivität von X, Phosphatase-Aktivität von X, Transkriptionsaktivität von X, Phosphorylierung am Rest Y.

Was ist der Unterschied zwischen RNA-Expression und Transkriptionsaktivität? Und welches misst ein Affymetrix-Mikroarray? z.B.; Transkriptionsaktivität von KLF2, Transkriptionsaktivität von ATF2 RNA-Expression von HSPA1A-RNA und Expression von CYP1B1


In Ihrem Fall unterscheiden sich die RNA-Expression und die Transkriptionsaktivität wahrscheinlich im Stadium der Verarbeitung. Transkriptionsaktivität bezieht sich auf die Bindungs- und Verarbeitungsaktivität der RNA-Polymerase. Es gibt verschiedene Möglichkeiten, dies experimentell zu messen, aber mit einem Mikroarray messen Sie die Menge der tatsächlichen Transkripte im Vergleich zum Kontrollarray.

Die RNA-Expression bezieht sich normalerweise auf die Menge an reifen Transkripten, wird aber oft synonym mit Transkriptionsaktivität verwendet. Die Unterscheidung erfolgt im Stadium der Probenextraktion und ob die RNA selektiv unter Verwendung von Poly-A-Selektion oder anderen Methoden, die reife Transkripte isolieren, gewonnen wurde oder nicht.

Was Ihr Microarray misst, hängt von der auf dem Array aufgebauten Sondenbibliothek ab und davon, ob Sie Gesamt-RNA oder selektive RNA verwenden. Sonden, die mit reifen Transkripten übereinstimmen, berichten für die RNA-Expression. Sonden, die mit unreifen oder entstehenden Transkripten übereinstimmen, können verwendet werden, um die transkriptionelle Aktivität zu messen.

Ein sorgfältiges Sondendesign ist erforderlich, um zwischen den verschiedenen Verarbeitungsstufen zu unterscheiden.