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Topologie des Proteins

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Die Domänenstruktur von Protein Z, das aus 180 Aminosäuren besteht, ist im oberen Teil der folgenden Abbildung dargestellt. Protein Z wird an einem Cysteinrest (der dritten Aminosäure) durch den im Kasten gezeigten Mechanismus palmitoyliert.

Welches der folgenden Diagramme zeigt die korrekte Topologie von Protein Z in der Plasmamembran?

Ich denke, das zweite Diagramm ist richtig, weil die zytoplasmatische Seite eine reduzierende Umgebung hat und SH daher nicht auf diese Weise reagieren darf. Habe ich recht ?


Ich glaube nicht, dass bei dieser Reaktion eine Oxidation oder Reduktion stattfindet; sicherlich gibt es keine Nettoreduktion oder Beteiligung des NADH-Cofaktors oder ähnliches. Außerdem denke ich, dass es nicht allzu schwer ist (insbesondere da es sich um enzymkatalysierte Reaktionen handelt), sich vorzustellen, dass der Mechanismus einfach ist: nukleophiler Angriff des Kohlenstoffs des Thioesters durch das Cystein, Bildung eines Thioketal-Zwischenprodukts, was zum Ausschleudern führt die CoASH als Abgangsgruppe. Keine Reduktion oder Oxidation.

Anstelle von Oxidation oder Reduktion würde ich darüber nachdenken, wo genau die Komponenten jeder Reaktion vorhanden sind. Damit die Palmitoylierungsreaktion ablaufen kann, benötigen Sie: den Protein-Z-N-Terminus, Palmitoyl-CoA und die Protein-Acyltransferase. Wo sind diese Komponenten eher vorhanden, innerhalb oder außerhalb der Zelle? Vor allem, da CoASH mehrere negativ geladene Phosphatgruppen besitzt.


Schau das Video: Topologi Jaringan: Pengertian, Jenis, dan Gambar Topologi Jaringan (September 2022).


Bemerkungen:

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