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Lernziele im Zusammenhang mit 2020_Winter_Bis2a_Facciotti_Lecture_25
- Definieren und erklären Sie die verschiedenen Vokabularbegriffe, die verwendet werden, um Mutationen zu beschreiben (Punkt, Deletion, Insertion, Nonsense, Frameshift, Null, Funktionsverlust und Funktionsgewinn) und in der Lage sein, ihren Einfluss auf die Proteinfunktion vorherzusagen.
- Verwenden Sie eine Codon-Tabelle und Ihr Wissen über Proteinstruktur und -funktion, um Vorhersagen zu treffen, wie spezifische Veränderungen auf DNA-Ebene die Proteinstruktur und -funktion beeinflussen könnten.
- Erklären Sie die möglichen verschiedenen Mechanismen, durch die Mutationen Veränderungen des Phänotyps verursachen können. Beziehen Sie Mutationen sowohl in proteinkodierenden Regionen als auch in nicht-proteinkodierenden Regionen in Ihre Diskussion ein.
- Erklären Sie den potenziellen Einfluss von Mutationen auf die Spezifität und Affinität von Protein-DNA-Interaktionen und den potenziellen Einfluss dieser Mutationen auf die Genexpression.
- Nennen Sie die Anforderungen an die Zellteilung und wie sich diese auf die verschiedenen Phasen des Zellzyklus beziehen.
- Identifizieren Sie die Signale, die für den Eintritt in die verschiedenen Phasen des Zellzyklus verantwortlich sind, was passiert, wenn diese
sind gestört , undwie unterschiedliche Regulierungsformen genutzt werden könnten . - Vergleichen und kontrastieren Sie die Abfolge von Ereignissen, die während auftreten müssen Mitose versus Meiose und warum sie notwendig sind: umfassen die Rolle von Mikrotubuli, Motorproteinen, Zentrosomen und den Grad der DNA-Kondensation.
- Vergleichen und kontrastieren Sie das Verhalten von Schwesterchromatiden, Chromosomen und homologen Chromosomen in der Mitose gegenüber der Meiose.
Mutationen
Fehler, die während der DNA-Replikation auftreten, sind nicht der einzige Weg, durch den Mutationen in der DNA entstehen können. Induzierte Mutationen sind solche, die aus der Exposition gegenüber Chemikalien, UV-Strahlen, Röntgenstrahlen oder anderen Umwelteinflüssen resultieren. Spontane Mutationen ohne Exposition gegenüber Umwelteinflüssen auftreten; sie resultieren aus spontanen biochemischen Reaktionen, die innerhalb der Zelle stattfinden.
Mutationen können vielfältige Auswirkungen haben.
stille Mutationen. Punktmutationen sind die Mutationen, die ein einzelnes Basenpaar betreffen. Die häufigsten Nukleotidmutationen sind Substitutionen,
. Diese können von zwei Arten sein, entweder Übergänge oder Transversionen. Übergangssubstitution bezeichnet ein Purin oder Pyrimidin, das durch eine Base der gleichen Art ersetzt ist; zum Beispiel,
. Transversionssubstitution bezieht sich auf ein Purin, das durch ein Pyrimidin ersetzt wird, oder umgekehrt; zum Beispiel Cytosin, ein Pyrimidin,
durch Adenin, ein Purin. Mutationen können auch
das Anfügen eines Nukleotids, bekannt als Insertion, oder das Entfernen einer Base, auch bekannt als Deletion. Manchmal kann ein DNA-Stück von einem Chromosom auf ein anderes Chromosom oder in eine andere Region desselben Chromosoms verlagert werden;
als Translokation.
Wie wir später sehen werden, kann eine Mutation in einer proteinkodierenden Region mehrere Auswirkungen haben. Transitions- oder Transversionsmutanten können zu keiner Veränderung der Proteinsequenz führen (bekannt als stille Mutationen), ändern Sie die Aminosäuresequenz (bekannt als Missense-Mutationen) oder erstellen
ein Stoppcodon (bekannt als a Unsinn Mutation). Insertionen und Deletionen in proteinkodierenden Sequenzen führen zu Frameshift-Mutationen. Missense-Mutationen, die zu führen konservative Veränderungen führt zur Substitution ähnlicher, aber nicht identischer Aminosäuren. Zum Beispiel würde die saure Aminosäure Glutamat die saure Aminosäure Aspartat ersetzen
konservativ. Wir erwarten nicht, dass diese Arten von Missense-Mutationen so schwerwiegend sind wie a nicht konservativ Aminosäureänderung; wie ein Glutamat, das ein Valin ersetzt. Aus unserem Verständnis der Chemie funktioneller Gruppen können wir richtig folgern, dass dies
Substitution kann je nach Ort der Mutation zu schwerwiegenden funktionellen Konsequenzen führen.
Hinweis: Vokabular Watch
Beachten Sie, dass der vorherige Absatz viele potenziell neue Vokabeln enthielt – es wäre eine gute Idee, diese Begriffe zu lernen.
Abbildung 1. Mutationen können zu Veränderungen der von der DNA kodierten Proteinsequenz führen.
Mutationen: Einige Nomenklaturen und Überlegungen
Mutation
Etymologisch bedeutet der Begriff Mutation eine Veränderung oder Veränderung. In der Genetik ist eine Mutation eine Veränderung des genetischen Materials – der DNA-Sequenz – eines Organismus. Im weiteren Sinne ist eine Mutante der Organismus, in dem eine Mutation aufgetreten ist. Aber was ist die Veränderung gegenüber? Die Antwort auf diese Frage ist, dass es darauf ankommt. Wir können den Vergleich mit dem direkten Vorläufer (Zelle oder Organismus) machen oder
Wildtyp vs Mutant
Was verstehen wir unter "Wildtyp"? Da die Definition kontextabhängig sein kann, ist dieses Konzept nicht ganz einfach. Hier sind ein paar Beispiele für Definitionen, auf die Sie stoßen könnten:
Mögliche Bedeutungenvom "Wildtyp"
- Ein Organismus mit einem für die Art in einer natürlichen Brutpopulation charakteristischen Aussehen (d. h. Flecken eines Geparden und tränenähnliche dunkle Streifen, die sich von den Augen bis zum Mund erstrecken).
- Die Form oder Formen eines Gens am häufigsten vorkommend in der Natur in a
gegeben Spezies. - Ein Phänotyp, Genotyp oder Gen das überwiegt in einer natürlichen Population von Organismen oder einem Stamm von Organismen im Gegensatz zu natürlichen oder im Labor mutierten Formen.
- Das normale, im Gegensatz zum mutierten Gen oder Allel.
auf der "Norm" für eine Reihe von Merkmalen
ein spezifisches Merkmal im Vergleich zur Gesamtbevölkerung. Im "Pre-DNA-Sequenzierungszeitalter"
basierend auf gemeinsamen Phänotypen (wie sie aussahen, wo sie lebten, wie sie sich verhielten usw.). Eine „Norm“
für die betreffende Sorte. Krähen haben zum Beispiel gemeinsame Merkmale, sie sind große, schwarze Vögel, die in bestimmten Regionen leben, bestimmte Arten von Nahrung fressen und sich auf eine bestimmte charakteristische Weise verhalten. Wenn wir einen sehen, wissen wir es
eine Krähe, die auf diesen Eigenschaften basiert. Wenn wir einen mit einem weißen Kopf sehen würden, würden wir denken
entweder ist es ein anderer Vogel (keine Krähe) oder eine Mutante, eine Krähe, die sich von der Norm oder vom Wildtyp unterscheidet.
In diesem Kurs nehmen wir das Gemeinsame an diesen unterschiedlichen Definitionen und übernehmen die Idee, dass "Wildtyp"
ein Referenzstandard, mit dem wir Mitglieder einer Population vergleichen können.
Mögliche NB-Diskussion Punkt
Wenn Sie einem Hund Wildtypmerkmale zuordnen würden, welche wären das? Was ist der Unterschied zwischen einem mutierten Merkmal und einer Variation eines Merkmals in einer Hundepopulation? Gibt es einen Wildtyp für einen Hund, den wir als Standard verwenden könnten? Wie würden wir
Mutationen sind
Folgen von Mutationen
Für ein Individuum kann die Folge von Mutationen wenig bedeuten oder Leben oder Tod bedeuten. Einige schädliche Mutationen sind Null oder schlagen
Mutationen und Krebs
Mutationen können entweder Körperzellen oder Keimzellen betreffen. Manchmal treten Mutationen in DNA-Reparaturgenen auf, wodurch die Fähigkeit der Zelle beeinträchtigt wird, andere möglicherweise auftretende Mutationen zu reparieren. Wenn,
Folgen von Fehlern bei Replikation, Transkription und Übersetzung
Etwas Wichtiges zum Nachdenken:
Zellen haben eine Vielzahl von Möglichkeiten entwickelt, um sicherzustellen, dass DNA-Fehler sowohl erkannt als auch korrigiert werden.
Mutationen als Instrumente der Veränderung
Durch Mutationen können sich Populationen an sich ändernde Umweltbelastungen anpassen
Mutationen
Beispiel: Antibiotikaresistenz
Das Bakterium E coli ist empfindlich gegenüber einem Antibiotikum namens Streptomycin, das die Proteinsynthese durch Bindung an das Ribosom hemmt.
Unkorrigierte Fehler bei der DNA-Replikation führen zu Mutationen. In diesem Beispiel,
Quelle: Bis2A Team Originalbild
Ein Beispiel: Laktatdehydrogenase
Laktatdehydrogenase (LDH), das Enzym, das bei der Fermentation den Abbau von Pyruvat zu Milchsäure katalysiert, während praktisch jeder Organismus diese Aktivität besitzt, unterscheidet sich das entsprechende Enzym und damit Gen zwischen Mensch und Bakterie immens.
Mögliche NB-Diskussion Punkt
Wir können vergleichende DNA-Sequenzanalysen verwenden, um Hypothesen über die evolutionären Beziehungen zwischen drei oder mehr Organismen aufzustellen. Eine Möglichkeit, dies zu erreichen, besteht darin, die DNA- oder Proteinsequenzen von Proteinen zu vergleichen, die in jedem der Organismen, die wir vergleichen möchten, gefunden werden. Stellen wir uns zum Beispiel vor, wir würden die Sequenzen der Laktatdehydrogenase (LDH) von drei verschiedenen Organismen vergleichen. Das folgende Schema zeigt die Primärstrukturen der LDH-Proteine der Organismen A, B und C. Die Buchstaben in der Mitte des Liniendiagramms der Proteine repräsentieren Aminosäuren an einer einzigartigen Position und die vorgeschlagenen Unterschiede in den einzelnen Sequenzen (Attribution:
Anwendung im wirklichen Leben:
Wie wir im Modul "Mutationen und Mutanten" gesehen haben, kann bereits die Änderung nur eines Nukleotids große Auswirkungen auf das translatierte Produkt haben. Lesen Sie hier mehr über die Arbeit eines Studenten zu Punktmutationen und GVO.
GLOSSAR
- induzierte Mutation:
Mutation die aus der Exposition gegenüber Chemikalien oder Umwelteinflüssen resultieren
- Mutation:
Variation in der Nukleotidsequenz eines Genoms
- Reparatur von Fehlanpassungen:
Art des Reparaturmechanismus, bei dem
nicht übereinstimmende Basen werden entfernt nach der Replikation
- Nukleotidexzisionsreparatur:
Art des DNA-Reparaturmechanismus, bei dem die falsche Base zusammen mit einigen Nukleotiden stromaufwärts oder stromabwärts,
werden entfernt
- Korrekturlesen:
Funktion der DNA
pol in dem es die neu hinzugefügte Basis liest, bevor die nächste hinzugefügt wird
- Punktmutation:
Mutation das betrifft eine einzelne basis
- stille Mutation:
Mutation daswird nicht ausgedrückt
- spontane Mutation:
Mutation das findet in den Zellen stattals Ergebnis von chemischen Reaktionen, die auf natürliche Weise ohne Einwirkung von äußeren Einflüssen ablaufen
- Übergangssubstitution:
wenn ein purin
ist ersetzt mit einem Purin oder einem Pyrimidinist ersetzt mit einem anderen Pyrimidin
- Transversionsersatz:
wenn ein purin
ist ersetzt durch ein Pyrimidin oder ein Pyrimidinist ersetzt durch ein Purin
Eukaryontischer Zellzyklus und Mitose
Der Zellzyklus ist eine geordnete Abfolge von Ereignissen, die von biologischen Systemen verwendet wird, um die Zellteilung zu koordinieren. Bei Eukaryoten verläuft die asexuelle Zellteilung über einen Zellzyklus, der mehrere räumlich und zeitlich koordinierte Ereignisse umfasst. Dazu gehört eine lange Vorbereitungszeit, genannt Zwischenphase, und ein mitotisch Phase, die als M-Phase bezeichnet wird. Die Interphase wird oft weiter in unterscheidbare Subphasen unterteilt, die als bezeichnet werden g1, S, und g2 Phasen. Mitose ist
Zellzyklus
Bei sich asexuell vermehrenden eukaryotischen Zellen ist eine „Umdrehung“ des Zellzyklus
Zwischenphase
G1-Phase
Die erste Phase der Interphase
Eine Zelle durchläuft geordnet eine Reihe von Phasen. Während der Zwischenphase ist G1 umfasst das Zellwachstum und die Proteinsynthese, die S-Phase umfasst die DNA-Replikation und die Replikation des Zentrosoms, und G2 beinhaltet weiteres Wachstum und Proteinsynthese. Die mitotische Phase folgt der Interphase. Mitose ist eine Kernteilung, bei der duplizierte Chromosomen
S-Phase
Während der Interphase verbleibt die Kern-DNA in einer halbkondensierten Chromatin-Konfiguration. In S-Phase (Synthesephase) führt die DNA-Replikation zur Bildung von zwei identischen Kopien jedes Chromosoms –Schwesterchromatiden-das
in der Zentromerregion. Am Ende dieser Phase,
.
In Zellen mit den Organellen namens Zentrosomen,
während der S-Phase. Zentrosomen
ein paar stabförmige Zentriolen bestehend aus Tubulin und anderen Proteinen, die im rechten Winkel zueinander sitzen. Die beiden resultierenden Zentrosomen führen zu dem mitotische Spindel, der Apparat, der die Bewegung der Chromosomen später während der Mitose orchestriert.
G2-Phase
Während der G2-Phase, oder zweite Lücke, füllt die Zelle ihre Energiespeicher auf und synthetisiert die für die Chromosomenmanipulation notwendigen Proteine. Einige Zellorganellen
G0-Phase
Nicht alle Zellen halten sich an das klassische Zellzyklusmuster, bei dem eine neu gebildete Tochterzelle sofort in die Interphase eintritt, dicht gefolgt von der mitotischen Phase. Zellen im G0-Phase bereiten sich nicht aktiv auf eine Teilung vor. Die Zelle befindet sich in einem ruhenden (inaktiven) Stadium, nachdem sie den Zellzyklus verlassen hat. Einige Zellen geben G . ein0 vorübergehend, bis ein externes Signal das Einsetzen von G . auslöst1. Andere Zellen, die sich nie oder selten teilen, wie reife Herzmuskel- und Nervenzellen, verbleiben in G0 permanent.
Kurz beiseite: Struktur der Chromosomen während des Zellzyklus
Wenn wir die DNA von allen 46 Chromosomen Ende an Ende anordnen, würde sie ungefähr zwei Meter messen; sein Durchmesser wäre jedoch nur 2
Doppelsträngige DNA wickelt sich um Histonproteine, um Nukleosomen zu bilden, die wie „Perlen an einer Schnur“ erscheinen.
Mitose und Zytokinese
Während der mitotische Phase, durchläuft eine Zelle zwei Hauptprozesse. Zuerst vervollständigt es die Mitose, während der der Inhalt des Kerns
Notiz
Die Hauptphasen der Mitose unterscheiden sich optisch voneinander und
Die Stadien der Zellteilung überwachen die Trennung von identischem genetischem Material in zwei neue Kerne, gefolgt von der Teilung des Zytoplasmas.
Prophase
Prophase ist die erste Phase der Mitose, in der sich das lose gepackte Chromatin zusammenrollt und zu sichtbaren Chromosomen kondensiert. Während der Prophase wird jedes Chromosom mit seinem identischen Partner sichtbar (Schwesterchromatid) befestigt und bildet die bekannte X-Form der Schwesterchromatiden. Der Nukleolus verschwindet in dieser Phase früh und auch die Kernhülle zerfällt.
Ein wichtiges Vorkommen während der Prophase betrifft eine sehr wichtige Struktur, die die Ursprungsstelle für das Mikrotubuli-Wachstum enthält. Zelluläre Strukturen, die als Zentriolen bezeichnet werden und als Ausgangspunkte dienen, von denen Mikrotubuli ausgehen. Diese winzigen Strukturen spielen auch während der Mitose eine sehr wichtige Rolle. EIN Zentrosom ist ein Paar Zentriolen zusammen. Die Zelle enthält zwei Zentrosomen nebeneinander, die
Gegen Ende der Prophase kommt es zu einer Invasion des Kernbereichs durch Mikrotubuli aus der mitotischen Spindel. Die Kernmembran ist zerfallen und die Mikrotubuli heften sich an die Zentromere, die an Paare von Schwesterchromatiden angrenzen. Die Kinetochor ist eine Proteinstruktur auf dem Zentromer, die die Bindungsstelle zwischen der mitotischen Spindel und den Schwesterchromatiden darstellt.
Metaphase
Die Metaphase ist die zweite Phase der Mitose. Während dieser Phase reihen sich die Schwesterchromatiden mit ihren daran befestigten Mikrotubuli entlang einer linearen Ebene in der Mitte der Zelle auf. Zwischen den Zentrosomen bildet sich eine Metaphasenplatte, die
Anaphase
Anaphase ist das dritte Stadium der Mitose. Anaphase findet über einige Minuten statt, wenn die Paare der Schwesterchromatiden
Telophase
Die Telophase ist das letzte Stadium der Mitose.
Zytokinese
Die Zytokinese ist der zweite Teil der mitotischen Phase, in der die Zellteilung
In Zellen wie tierischen Zellen, die
In Pflanzenzellen ist eine Spaltfurche wegen der die Plasmamembran umgebenden starren Zellwände nicht möglich. Zwischen den Tochterzellen muss sich eine neue Zellwand bilden. Während der Interphase sammelt der Golgi-Apparat Enzyme, Strukturproteine und Glukosemoleküle, bevor er in Vesikel zerfällt und sich in der sich teilenden Zelle verteilt. Während der Telophase bewegen sich diese Golgi-Vesikel auf Mikrotubuli, um sich an der Metaphase-Platte zu sammeln. Dort verschmelzen die Vesikel von der Mitte zu den Zellwänden; diese Struktur
In Teil (a) bildet sich an der ehemaligen Metaphasenplatte in der Tierzelle eine Spaltfurche.
ZellzyklusKontrollpunkte
Es ist wichtig, dass Tochterzellen nahezu exakte Duplikate der Elternzelle sind. Fehler bei der Vervielfältigung oder Verteilung der Chromosomen führen zu Mutationen, die an jede neue Zelle weitergegeben werden können, die aus der abnormalen Zelle hervorgegangen ist. Um zu verhindern, dass sich eine kompromittierte Zelle weiter teilt, gibt es interne Kontrollmechanismen, die auf drei Zellzyklus-Checkpoints bei welchem
G1 Kontrollpunkt
Das G1 Checkpoint bestimmt, ob alle Bedingungen günstig sind, damit die Zellteilung in die S-Phase übergeht, in der die DNA-Replikation stattfindet. Das G1 Checkpoint, auch Restriktionspunkt genannt, ist der Punkt, an dem sich die Zelle irreversibel auf den Zellteilungsprozess einlässt. Neben ausreichenden Reserven und Zellgröße wird am G . auf Schäden an der genomischen DNA geprüft1 Kontrollpunkt.
G2-Checkpoint
Das G2 Checkpoint-Bars
M Kontrollpunkt
Der M-Checkpoint tritt gegen Ende des Metaphase-Stadiums der Mitose auf.
Notiz
Beobachten Sie, was beim G . passiert1, G2, und M Checkpoints, indem Sie diese Animation des Zellzyklus besuchen.
Wenn der Zellzyklus außer Kontrolle gerät
Die meisten Menschen verstehen, dass Krebs oder Tumore
Der Prozess, bei dem eine Zelle ihrem normalen Kontrollsystem entkommt und krebsartig wird, kann
Homöostatische Ungleichgewichte: Krebs entsteht aus homöostatischen Ungleichgewichten
Krebs ist
Diese beiden gegensätzlichen Klassen von Genen, Proto-Onkogene und Tumorsuppressorgene, sind wie das Gas- bzw. Bremspedal des zelleigenen „Cruise Control Systems“. Unter normalen Bedingungen halten diese an und gehen
Ein feines homöostatisches Gleichgewicht zwischen den vielen Proto-Onkogenen und Tumorsuppressorgenen steuert den Zellzyklus feinfühlig und sorgt dafür, dass sich nur gesunde Zellen vermehren. Daher kann eine Störung dieses homöostatischen Gleichgewichts eine abnormale Zellteilung und krebsartige Wucherungen verursachen.